hCov-OC43-Panel Pseudovirus Standard Reference
CBV30027
| I. 背景 | |
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HCoV-229E和HCoV-OC43都是在1960年代发现的，多年来一直被公认为引起普通感冒的原因，并在一生中引起频繁的再感染。在成年人中，这些病毒每年占急性呼吸道疾病的 4％至15％，在高峰期高达35％。儿童的年发病率达到8％，最高发病率高达20％。据报道，成人中229E和OC43病毒的感染频率为每年每100人15至25人不等，其中有80％的感染者是先前具有该感染病毒抗体的人。 根据CDC和WHO的介绍，针对HCoV-OC43的核酸诊断一般是针对ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene N和Gene E， Gene S更多用于对应药物和疫苗的开发。NCBI收录序列为KX344031.1，全长30713bp，基因编码5个结构蛋白：S，M，N，HE和E。 以往针对试剂盒检测限的性能评价，一般是选择体外转录的RNA、或者临床阳性病毒来作为标准品，用于性能评价。但是两者都具有很明显的确定，首先体外转录的RNA，一般是很纯，单一，不涉及提取，不符合临床病毒的微环境，因此必然造成检测灵敏度被高估，这也是存在高概率假阴性的主要原因；再次临床阳性病毒，即使是灭活的病毒，也是存在很大的生物安全隐患，因此要求实验室级别为P3-P4，大部分开发诊断试剂盒单位都不满足改要求，另外临床阳性病毒也是来源很有限，不能被稳定供应，反复用于试剂盒的性能评价。 |
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| II.产品描述 | |
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有病毒的完整包膜结构，有HCoV-OC43对应的核酸序列，但是生物安全风险较低的假病毒标准品，完美的克服了选择体外转录的RNA、或者临床阳性病毒来作为标准品的缺点，非常适合用于核酸诊断性能评价的标准品。 构建过程：HCoV-OC43基因合成→假病毒包装→纯化→QC检测（ddPCR） |
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| III. 产品介绍 | |
| 产品名称: | hCov-OC43-E Pseudovirus Standard Reference |
| 对应序列（详情见附录）: |
ORF1ab/RdRP(2783bp)、Gene N(1347bp)、Gene E(255bp) |
| 产品规格: | 1ml |
| 拷贝数: | |
| 生物安全级别: | P2 |
| 运输与保存方式: | 干冰运输，-90 ~ -70°C保存 |
| 有效期: | |
| IV. 产品用途与优势 | |
| 产品用途: | HCoV-OC43诊断试剂盒性能评价 |
| 产品优势: | • HCoV-OC43的假病毒标准品，区别于以往体外合成的RNA、临床阳性活病毒，完美克服两者的缺点，真正适合用于试剂盒的性能评价，包含检测限、特异性，重复性等；
• 根据HCoV-OC43冠状病毒的特点，选取了ORF1ab/RdRP（RNA-dependent RNA polymerase）、Gene E(envelope protein)、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)合计3个区段的序列，用于假病毒的包装，3个区段很好的表征了HCoV-OC43的特征序列； • 304am永利集团设计了ddPCR体系的引物、探针序列，可不需要构建标准曲线的前提下完成对假病毒的QC拷贝数检测，非常准确表征标准品的拷贝数，而且克服了Q-PCR分析CT值的相对判断标准的不准确性； • 假病毒标准品，无致病性，可再生，质控方法可靠，批次间稳定，可以长期稳定制备和供应，而且要求实验室生物安全级别为P2，满足很多单位的安全需求。 |
| Ⅴ. 附录 | |
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ORF1ab/RdRP: TCAAAAGATACTAATTTTTTAAACGGGTTCGGGGTACGAGTGTAGATGCCCGTCTCGTACCCTGCGCCAGTGGTTTATCTACTGATGTACAATTAAGGGCATTTGATATTTACAATGCTAGTG TTGCTGGCATTGGTTTACATTTAAAAGTTAATTGTTGCCGTTTTCAGCGTGTTGATGAGAACGGTGATAAATTAGATCAGTTCTTTGTTGTTAAGAGGACAGATCTGACTATATATAATAGAG AGATGAAATGCTATGAGCGTGTAAAAGATTGTAAGTTTGTGGCTGAACACGATTTCTTTACATTTGATGTAGAAGGTAGTCGTGTGCCACACATTGTACGCAAGGATTTAACAAAGTATACTA TGTTGGATCTTTGCTATGCATTGCGACATTTTGATCGCAATGATTGCATGCTGCTTTGTGACATTCTCTCTATATATGCTGGTTGTGAACAATCCTACTTTACTAAGAAGGATTGGTATGATT TTGTTGAAAATCCTGATATTATTAATGTGTATAAAAAGCTAGGACCTATTTTTAATAGAGCCCTAGTTAGCGCTACTGAGTTTGCGGACAAATTGGTGGAGGTAGGCTTAGTAGGCGTTTTAA CACTTGATAATCAAGATTTAAATGGTAAATGGTATGATTTTGGTGACTATGTTATTGCAGCCCCAGGATGTGGTGTTGCTATAGCAGATTCTTATTATTCTTATATCATGCCTATGCTGACCA TGTGTCATGCATTGGATTGCGAATTGTATGTGAATAATGCTTATAGACTATTTGATCTTGTACAGTATGATTTTACTGATTACAAGCTTGAATTGTTTAATAAGTATTTTAAGCACTGGAGTA TGCCATATCATCCTAACACTGTTGATTGTCAGGATGATCGGTGTATTATACATTGTGCTAATTTTAACATACTTTTTAGTATGGTTTTACCTAATACATGTTTTGGGCCTCTTGTTAGGCAAA TTTTTGTGGATGGTGTGCCTTTTGTTGTTTCAATTGGCTACCATTATAAAGAACTTGGTATTGTGATGAATATGGATGTGGATACACATCGTTATCGCTTGTCTTTAAAAGACTTGCTTTTAT ATGCTGCTGATCCAGCTTTGCATGTAGCTTCTGCTAGTGCATTGTATGATTTACGCACTTGCTGTTTTAGTGTTGCCGCTATAACAAGCGGTGTAAAATTTCAAACAGTTAAACCTGGTAATT TTAATCAGGATTTTTATGATTTTGTTTTAAGTAAAGGCCTGCTTAAAGAGGGTAGCTCAGTTGATCTGAAGCACTTTTTCTTTACACAGGATGGTAATGCTGCTATTACTGATTATAATTATT ATAAGTATAATTTGCCCACCATGGTGGACATTAAGCAGTTGTTGTTTGTTTTGGAAGTTGTTTATAAGTATTTTGAGATTTATGATGGTGGGTGTATACCGGCATCACAAGTCATTGTTAATA ATTATGATAAGAGTGCTGGCTATCCATTTAACAAATTTGGAAAAGCCAGGCTCTATTATGAAGCATTATCATTTGAGGAACAGGATGAAATTTACGCTTATACTAAGCGTAATGTCCTGCCAA CACTTACTCAAATGAATTTGAAATATGCTATTAGTGCTAAGAATAGAGCCCGCACTGTTGCTGGTGTTTCCATACTTAGTACTATGACTGGCAGAATGTTTCATCAAAAATGTTTGAAAAGTA TAGCAGCTACACGTGGTGTTCCTGTAGTTATAGGCACCACTAAATTTTATGGTGGCTGGGATGATATGTTACGCCGCCTTATTAAAGATGTTGACAATCCTGTACTTATGGGTTGGGATTATC CTAAGTGTGATCGTGCTATGCCAAACCTACTACGTATTGTTAGTAGTTTGGTATTAGCCCGAAAACATGAGACATGTTGTTCGCAAAGCGATAGGTTTTATCGACTTGCGAATGAATGCGCAC AAGTTTTGAGTGAAATTGTTATGTGTGGTGGCTGTTATTATGTTAAGCCTGGTGGCACTAGTAGTGGTGATGCAACTACTGCTTTTGCTAATTCAGTCTTTAACATATGTCAAGCTGTTTCAG CCAATGTATGTGCCTTAATGTCATGCAATGGCAATAAGATTGAAGATCTTAGTATACGTGCTCTTCAGAAGCGCTTATACTCACATGTGTATAGAAGTGATAAGGTTGATTCAACCTTTGTCA CAGAATATTATGAATTTTTAAATAAGCATTTTAGTATGATGATTTTGAGTGATGATGGGGTTGTGTGTTATAATTCTGATTATGCGTCCAAAGGGTATATTGCTAATATAAGTGCCTTTCAAC AGGTATTATATTATCAAAATAACGTTTTTATGTCAGAATCCAAATGTTGGGTTGAACATGACATAAATAATGGACCTCATGAATTCTGTTCACAACACACAATGCTTGTAAAGATGGATGGTG ACGATGTCTACCTTCCATATCCTAATCCTAGTCGTATATTAGGAGCTGGATGTTTTGTAGATGATTTGTTAAAGACTGATAGTGTTCTTTTAATAGAACGATTTGTAAGTCTTGCAATAGATG CTTATCCACTTGTGTATCATGAAAATGAAGAATACCAAAAGGTTTTTCGTGTTTATTTGGCGTATATAAAGAAGTTGTACAATGACCTGGGTAATCAGATCTTGGATAGCTACAGTGTTATTT TAAGTACTTGTGATGGACAAAAGTTCACTGATGAGTCCTTTTACAAGAACATGTATTTAAGAAGTGCAGTTATGCAG
Gene N: ATGTCTTTTACTCCTGGTAAGCAATCCAGTAGTAGAGCGTCCTCTGGAAATCGTTCTGGTAATGGCATCCTCAAGTGGGCCGATCAGTCCGACCAGTTTAGAAATGTTCAAACCAGGGGTAGA AGAGCTCAACCCAAGCAAACTGCTACCTCTCAGCAACCATCAGGAGGGAATGTTGTACCCTACTATTCTTGGTTCTCTGGAATTACTCAGTTTCAAAAGGGAAAGGAGTTTGAGTTTGTAGAA GGACAAGGTGTGCCTATTGCACCAGGAGTCCCAGCTACTGAAGCTAAGGGGTACTGGTACAGACACAACAGACGTTCTTTTAAAACAGCCGATGGCAACCAGCGTCAACTGCTGCCACGATGG TATTTTTACTATCTGGGAACAGGACCGCATGCTAAAGACCAGTACGGCACCGATATTGACGGAGTCTACTGGGTCGCTAGCAACCAGGCTGATGTCAATACCCCGGCTGACATTGTCGATCGG GACCCAAGTAGCGATGAGGCTATTCCGACTAGGTTTCCGCCTGGCACGGTACTCCCTCAGGGTTACTATATTGAAGGCTCAGGAAGGTCTGCTCCTAATTCCAGATCTACTTCGCGCACATCC AGCAGAGCCTCTAGTGCAGGATCGCGTAGTAGAGCCAATTCTGGCAATAGAACCCCTACCTCTGGTGTAACACCTGACATGGCTGATCAAATTGCTAGTCTTGTTCTGGCAAAACTTGGCAAG GATGCCACTAAACCTCAGCAAGTAACTAAGCATACTGCCAAAGAAGTCAGACAGAAAATTTTGAATAAGCCCCGCCAGAAGAGGAGCCCCAATAAACAATGCACTGTTCAGCAGTGTTTTGGT AAGAGAGGCCCTAATCAGAATTTTGGTGGTGGAGAAATGTTAAAACTTGGAACTAGTGACCCACAGTTCCCCATTCTTGCAGAACTCGCACCCACAGCTGGTGCGTTTTTCTTTGGATCAAGA TTAGAGTTGGCCAAAGTGCAGAATTTATCTGGGAATCCTGACGAGCCCCAGAAGGATGTTTATGAATTGCGCTATAACGGCGCAATTAGGTTTGACAGTACACTTTCAGGTTTTGAGACCATA ATGAAGGTGCTGAATGAGAATTTGAATGCCTATCAACAACAAGATGGTATGATGAATATGAGTCCAAAACCACAGCGTCAGCGTGGTCATAAGAATGGACAAGGAGAAAATGATAATATAAGT GTTGCAGTGCCCAAAAGCCGCGTGCAGCAAAATAAGAGTAGAGAGTTGACTGCAGAGGACATCAGCCTTCTTAAGAAGATGGATGAGCCCTATACTGAAGACACCTCAGAAATATAA
Gene E: ATGTTTATGGCTGATGCTTATCTTGCAGACACTGTGTGGTATGTGGGGCAAATAATTTTTATAGTTGCCATTTGTTTATTGGTTACAATAGTTGTAGTGGCATTTTTGGCAACTTTTAAATTG TGTATTCAACTTTGCGGTATGTGTAATACCTTAGTACTGTCCCCTTCTATTTATGTGTTTAATAGAGGTAGGCAGTTTTATGAGTTTTACAATGATGTAAAACCACCAGTCCTTGATGTGGAT GACGTTTAG |
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